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ANÁLISIS DE LA VARIABILIDAD GENÉTICA EN RAZAS EQUINAS AUTÓCTONAS ESPAÑOLAS DETECTADA MEDIANTE MICROSATÉLITES.Autor: CHECA CORTÉS M. LUISA. Año: 2003. Universidad: COMPLUTENSE DE MADRID. Centro de lectura: FACULTAD DE VETERINARIA. Centro de realización: FACULTAD DE VETERINARIA. Resumen: En la actualidad existe una gran proporción de razas que se encuentran en peligro de extinción, cuyas perspectivas de futuro dependen del establecimiento de programas de conservación, que deben estar sustentados, entre otros, sobre estudios de diversidad genética. Este trabajo estudia el estado genético de siete razas autóctonas de caballos españoles en peligro de extinción (Asturcón, Losina, Jaca Navarra, Pura raza de Caballo Gallego, Pottoka, Mallorquina y Menorquina) mediante la utilización de 13 microsatélites, ya que han demostrado ser la herramienta más adecuada para detectar la variabilidad genética entre razas estrechamente relacionadas. Estas siete razas fueron comparadas con una muestra poblacional de la Raza Pura Sangre Inglés. Tomando como medidas de diversidad genética intrapoblacional la heterocigosis y la diversidad alélica, se observaron diferencias significativas entre las razas autóctonas para el número de alelos observados, pero no para la heterocigosis (P menor 0,05). Tanto solo la Raza Mallorquina parece haber atravesado recientemente un cuello de botella, lo que está justificado por las diferencias encontradas entre la heterocigosis, y la diversidad alélica. Los dendrogramas construidos a partir de dos matrices de distancia, Da y FST, con una correlación de r=0,97, mostraron en ambos casos a las razas Mallorquina y Menorquina agrupadas en un clado distinto al reso de razas, estando más próximas a la Raza Pura Sangre Inglés. En el análisis de Correspondencia las razas Asturcón, Jaca Navarra y Losina, son las que contriubyen en mayor medida a la diversidad genética, para el primer, segundo y tercer factor, respectivamente. De los tres métodos utilizados para asignar o excluir poblaciones como irigen de individuos, el método Bayesiano fue el que mejores resutlados aportó, estando la eficacia en la asignación correlacionada positivamente con el nivel de diferenciación genética existente entre las razas probables. Los microsatélites más eficaces en la asignación variaron con las razas involucradas pero existe una correlación positiva entre el número de marcadores empleados y la eficacia en la asignación, aunque los costes de genotipado no compensan un empleo de más de diez a doce marcadores genéticos con este propósito. TOWARDS THE CHARACTERIZATION OF THE EUKARYOTIC SELENOPROTEOME: A COMPUTATIONAL APPROACHAutor: CASTELLANO HEREZA SERGI. Año: 2003. Universidad: POMPEU FABRA. Centro de lectura: DEPARTAMENT DE CIÈNCIES EXPERIMENTALS I DE LA SALUT. Centro de realización: DEPARTAMENTO DE CIENCIAS EXPERIMENTALES Y DE LA SALUD.
Resumen: Las selenoproteínas incorporan el aminoácido selenocisteina (Sec), un análogo de la cisteina (Cys) que contiene Se en lugar de S, en el proceso de traducción. Este aminoácido esta codificado por el docon UGA, normalmente utilizado como codon de terminación, lo que impide que los programas de predicción de genes identifiquen correctamente estas proteínas. Por este motivo, hemos desarrollado programas específicos para la predicción de genes de selenoproteinas en genomas eucariotas. Estos programas se han utilizado para identificar nuevas familias de estos genes en diversos organismos humanos, Drosophila, Takifugu i Tetraodon. El resultado de estos estudios son 9 familias nuevas de selenoproteinas. La anotación correcta de estos genes, nos ha permitido empezar a conocer la distribución de estos genes y de sus homólogos con cisteina en el linaje eucariota. Hemos observado una distribución en mosaico de los genes con Se o S, lo que podría indicar la existencia de un proceso muy dinámico de intercambio entre Sec y Cys en la evolución de estos genes. GENÉTICA MOLECULAR DE LAS EPILEPSIAS IDIOPÁTICAS GENERALIZADASAutor: SAÉZ HERNÁNDEZ LAURA. Año: 2004. Universidad: COMPLUTENSE DE MADRID. Centro de lectura: FACULTAD DE FARMACIA. Centro de realización: FUNDACIÓN JIMÉNEZ DÍAZ. Resumen: Esta tesis se basa en el estudio genetico de dos familias que padecen diferentes tipos de epilepsia idiopatica generalizada (EIG). La familia EIG-3 se encuentra compuesta por cuatro individuos: padre, madre y dos hijas. Unicamente las hijas se encuentran afectas, la probando padece epilepsia con ausencias en la infancia y la hermana padece crisis tonico-clonicas primarias solo. Tanto ellas como su madre son portadoras de una translocacion balanceada, reciproca t(4;6)(q35:p21). Nuestro trabajo consistio en la caracterizacion del punto de rotura de la translocacion en el cromosoma 6, donde localizamos dos nuevos canales de potasio: TALK-l y TALK-2. Estos canales se localizan a 3.5 Kb en la region 3 del punto de rotura de la translocacion. Analizamos la secuencia codificante de ambos canales en 51 individuos con EIG pero ninguna de las variaciones localizada parece estar implicada en el desarrollo del fenotipo afecto. La familia EIG-24 padece epilepsia generalizada con crisis febriles plus. Mediante analisis de ligamiento fue asociada al locus 2q24 y localizamos una mutacion puntual en la secuencia codificante de la subunidad a 1 del canal de sodio neuronal (SCN 1A). Realizamos el analisis funcional de esta mutacion en celulas CHO expresando la subunidad al del canal de sodio neuronal humano dependiente de voltaje, junto a las subunidades reguladoras beta1 y beta2. Observamos que las celulas que expresaban canales formados con la subuniadad al mutada presentaban una densidad de corriente muy inferior a las celulas que expresaban subunidades nativas. Del mismo modo observamos que el tiempo necesario para la recuperacion de estos canales tras su inactivacion, éra mayor en las subunidades mutadas que en las nativas. Estos resultados hacen pensar que esta mutacion podria estar alterando a la union entre las subunidades alfa 1 y beta 1. DESARROLLO Y CARACTERIZACIÓN DE NUEVOS MICROSATÉLITES Y SNPS Y APLICACIÓN EN LA MEJORA GENÉTICA DEL OLIVO (OLEA EUROPAEA L).Autor: DIAZ BERMUDEZ AURORA. Año: 2004. Universidad: CÓRDOBA. Centro de lectura: CIFA ALAMEDA DEL OBISPO. Centro de realización: CIFA ALAMEDA DEL OBISPO. Resumen: La diversidad genética existente dentro de la especie Olea europaea L. en toda la Cuenca Mediterránea es enorme. La conservación de este rico patrimonio genético resulta de vital importancia, evitándose así la erosión del mismo, lo que conduciría a un estrechamiento irreversible del acervo genético, como está sucediendo en muchos otros cultivos. Durante las últimas décadas, se han realizado importantes trabajos de prospección, recolección, caracterización y evaluación de los cultivares más destacados de olivo. Es en estos dos últimos puntos donde los marcadores moleculares juegan un papel decisivo. Al comienzo de este trabajo eran muy pocos los marcadores genéticos disponibles en olivo. Sirva como ejemplo que recientemente se habían "desarrollado los primeros microsatélites en esta especie. Para abordar cualquier trabajo de identificación cultivar, así como para explorar las relaciones filogenéticas dentro de la especie O. europaea L., resultaba esencial disponer de una amplia batería de marcadores genéticos. Por este motivo, uno de los primeros objetivos del presente trabajo consistió en el desarrollo de nuevos marcadores genéticos en olivo, concretamente microsatéliteso SSRs ("Simple Sequence Repeats") y SNPs ("Single Nucleotide Polymorphisms"). En el caso de los SSRs, se obtuvieron 12 marcadores, nueve de los cuales exhibieron polimorfismo (4-15 alelos por locus) en la población de 51 cultivares de olivo empleada para su caracterización. Con el empleo únicamente de cuatro de estos nuevos SSRs fue posible obtener un perfil genotípico único para cada uno de los 51 cultivares de olivo considerados. En cuanto a los 11 SNPs hallados, 3 de ellos fueron transformados con éxito en marcadores de tipo CAPS ("Cleaved Amplified Polymorphic Sequences"), los cuales suministraron unos valores del poder de discriminación relativamentealtos (teniendo en cuanta su naturaleza bialélica), incluso comparables en dos de ellos a los logrados para cuatro SSRs que presentaron entre 7 y 16 alelos en la misma población de 51 cultivares de olivo estudiada. Con los tres marcadores CAPS obtenidos se pudieron diferenciar sin ambigüedad 13 de los citados 51 cultivares. Dos de los SSRs obtenidos en el presente trabajo, junto con otros tres seleccionados de entre los disponibles en la bibliografía, proporcionaron un perfil único y característico de potenciales nuevas variedades obtenidas mediante cruzamientos controlados dentro del programa de mejora emprendido en Córdoba (Universidad de Córdoba, IFAPA). Únicamente en los individuos procedentes de los cruzamientos 'Picual' . 'Arbequina' y 'Frantoio' .'Picual' la paternidad asignada a priori fue la correcta. Por otro lado, para la elucidación de las relaciones filogenéticas entre los 51 cultivares en estudio se utilizaron 10 de los 12 SSRs aquí desarrollados, junto con cinco extraídos de la bibliografía. Los datos obtenidos revelaron una cierta tendencia de los cultivares a agruparse de acuerdo con su lugar de procedencia, resultando, así mismo, dichas relaciones coherentes con las rutas de dispersión del olivo, todo lo cual se hizo más patente entre el subgrupo de cultivares españoles. Se ha evaluado la influencia de distintos factores sobre el nivel de contaminación polínica, mediante el empleo de cuatro marcadores SSR. Fruto de ello, se ha diseñado un protocolo de polinízación que minimiza el riesgo de contaminación y simplifica los procedimientos empleados. Una de las características destacables de dicho protocolo consiste en la realización de una única polinización frente a las tres que se habían venido realizando hasta el momento. En este sentido, el nivel de inter-compatibilidad entre cultivares se ha revelado como el factor determinante en mayor medida del éxito en la obtención de la progenie deseada 8 . De est 2e5 e modo, se han clasificado los cultivares estudiados en base a su inter-compatibilidad. CARACTERIZACIÓN DE LAS ESPECIES DEL GÉNERO EUROTIUM CON ACTIVIDAD ACARICIDA E IDENTIFICACIÓN DE LA MOLÉCULA ACTIVAAutor: ORTIZ LEMUS JOSÉ FÉLIX. Año: 2005. Universidad: LEÓN. Centro de lectura: FACULTAD DE BIOLOGÍA. Centro de realización: FACULTAD DE VETERINARIA.
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