MOLECULAR PHYSICS

Autor: PÉREZ RUIZ RAÚL.
Jahr: 2006.
Universität: POLITÉCNICA DE VALENCIA.
Ort der Lesung: U.P.Valencia ( Dep. Quimica).
Ort der Vorbereitung: Universidad Politécnica de Valencia.

Inhaltsangabe: Die ciclorreversión (CR) oder oxidative reduktive der oxetanos durch elektronische Übertragung fotoinducida (TEF), wurde nicht untersucht und Tiefe, trotz der Tatsache, dass dieser Prozess hat weckte großes Interesse in den vergangenen zehn Jahren im Zusammenhang mit der Erforschung neuer synthetischer Routen und die Photochemie von DNA-Reparatur. Was über fotooxidativa, unter Berücksichtigung der theoretischen Berechnungen und experimentelle Daten, die bereits veröffentlicht hat, auf seine Art dachte, es wäre interessant, eine Pilot-Studie, die neue Erkenntnisse über den Reaktionsmechanismus. In diesem Zusammenhang, es wurde als Modell Substrat, trans trans-2-ciclopropil-3-phenyl-4-metiloxetano (1) hat klargestellt, mechanistische Aspekte der RC von oxidativen oxetanos. Die Spaltung von 1 für eine erste gebrochen C2-C3-Link führt zu den Verbindungen in der fotocicloadición der Patero-BÃ ¼ chi für die Synthese von 1. Im Gegensatz dazu, die Bildung einer fotoproducto wieder, weil der Erfassung nucleofílica intermolekularen von Zwischenprodukten, die aus der Zersplitterung zur Link-O-C2 von Acetonitril stimmt zu, einen Mechanismus vor. Was über fotorreductiva, wurde RC-Modell des Substrats, trans trans-2-(4-cianofenil)-3-phenyl-4-metiloxetano (4) mit dem 1-metoxinaftaleno als Photosensibilisator. Die experimentellen Daten stehen im Einklang mit der Reaktion, die stattfindet vom Unterhemd Stand der sensibilisierend. Die Zersplitterung der radikalen Anion von 4 auftritt, indem die Links O-C2-und C3-C4 führenden Produkten (Acetaldehyd und 4-cianoestilbeno) unterscheiden sich von denen für die Synthese von 4 durch die fotociloadición der Paterno-BÃ ¼ chi. Der Prozess geht durch den radikalen anion trans-4-cianoestilbeno, die entdeckt wurde durch FDL (? Max = 500 nm).

Autor: MANOJAS VASTFSÓN MARIA.
Jahr: 2006.
Universität: BARCELONA.
Ort der Vorbereitung: FACULTAD DE FÍSICA.

Inhaltsangabe: Die Arbeit in diese These stützt sich auf die Untersuchung der Falz-und RNA-Moleküle desplegamiento Mechaniker. Das Hauptziel ist es, Modelle zu entwickeln, dass fenomenólicos sind nützlich für die Interpretation von Experimenten resutlados einziges Molekül optische Pinzette. Unser strategisches Modell ist sowohl der RNA-Molekül als lso verschiedenen Elemente, die in den Experimenten zur Extraktion von Informationen Thermodynamik und Kinetik des Prozesses der Falz-und desplegamiento RNA.

Autor: MORENO GONZÁLEZ M. CARMEN.
Jahr: 2006.
Universität: GIRONA.
Ort der Lesung: ESCUELA POLITÉCNICA SUPERIOR IV.
Ort der Vorbereitung: UNVIERSITAT DE GIRONA.

Inhaltsangabe: In den letzten Jahren hat unsere Forschungs-Gruppe hat mehrere Erhebungen auf der Suche nach neuen biocontrol Agenten wirksam in der Kontrolle von Krankheiten nach der Ernte. Ein isolierter Stamm EPS125 wurde, die zeigte, hohe Wirksamkeit von biocontrol Pilz-Erreger Penicillium expansum, was verrottet der blauen und erhebliche wirtschaftliche Verluste in den post-Ernte Früchte. Dieser Stamm auch gezeigt werden, dass wirksam gegen ein breites Spektrum von Pilzinfektionen der Erreger Nacherntebereich als Botrytis cinerea, Monilinia lax und Rhizopus stolonnifer und in einer Vielzahl von Früchten. Aufgrund seiner hohen Wirksamkeit, wurde kommerziell entwickeln diese Belastung jedoch, um dieses Ziel zu erreichen, sollten Sie sich an eine gründliche Charakterisierung des Produktes Ebene Identifikation, Massen-Produktion, Design, Mechanismen biocontrol und Rückverfolgbarkeit. Bisher sind Themen wie Serienfertigung und Formulierung der Belastung EPS125 entwickelt wurden, erfolgreich abgeschlossen. Auch Näherungen auf den Mechanismus dieser Stamm von biocontrol durchgeführt worden, in denen die Ausgrenzung von defensiven Kolonisierung durch pathogene Nische und direkte Interaktion mit den Pilzsporen und Röhren germinativos haben offenbar eine Schlüsselrolle in der biocontrol. In der vorliegenden Arbeit wurde zu ergänzen die Informationen, die für die Zukunft der Registrierung biopesticida EPS125, die Sie zerbrechen: 1-Identifizierung und Charakterisierung der Belastung EPS125 durch genotypische und phänotypische Tests. 2-Entwicklung einer Methode zum Aufspüren EPS125 die Belastung durch spezifische molekulare Marker. 3-Bestimmung der Mechanismus, der verwendet wird, indem biocontrol strain EPS125 gegen P.expansum durch Annäherungen phänotypische und genotypische Untersuchungen. Nach dem Ergebnis der nachhaltigen morphologische und biochemische Tests, API 20E, Profile und Biolog Fettsäuren und Sequenzierung des Gens 16S rDNA, die Belastungen EPS125 ist innerhalb der Arten Pantowea agglomerans (Enterobacter agglomerans-Ervinia herbicola). Dieser Stamm zeigte Merkmale, die sich von anderen Arten, Erbsen und sogar von der gleichen Spezies. Genauer gesagt, im Gegensatz zu anderen Stämmen analysiert, die Belastungen EPS125 nicht in der Lage war zu benutzen als Quelle von Kohlenstoff zwischen 40, sondern im Gegenteil war die einzige Möglichkeit umwandeln Mono-methyl-succinat. Darüber hinaus wurden im Hinblick auf die zellulären Fettsäure-Profil gezeigt, indem die Belastung EPS125, war dies auch die einzige Person, zeigte w5c Fettsäuren 14:1, 15:0 und SIF1 ISO 3OH. In Bezug auf die genotypische Charakterisierung der Belastung EPS125 zeigte einen Polymorphismus in der Länge von Fragmenten macrorestricción Genomik MRFLP eigentümliche, bestehend aus 13 Fragmenten (302270259253197179165160140110,81 und 71 Kb) aus der Verdauung von DNA mit XbaI. Zwei DNA-spezifische molekulare Marker (125,2 und 125,3) für die Belastung EPS125 entwickelt worden, in diesem Papier. Jeder molekulare Marker erwiesen sich als semiespecífico für den Nachweis von PCR-Technik verwendet, wenn einzeln verstärken fünf Stämme P.agglomernas mit allen Grundierungen 125,2 und einem Stamm von der gleichen Art, mit allen 125,3 Primer für insgesamt 267 Stämme analysiert (257 Stämme der Spezies P . Agglomerans und 10 Stämme von anderen Genres). Aber im Gegensatz zu anderen Bakterien analysiert, die Stämme EPS125 war der einzige, die zeigten, Signalverstärkung mit beiden Primer. Dieses Ergebnis legt nahe, die mögliche Verwendung der Kombination der beiden molekularen Marker zur Untersuchung verfolgt die Belastung EPS-125 in einer PCR Reaktion mutiplex. P.agglomerans EPS125 hat die Merkmale, die für eine potenzielle biopesticida Handel als Abwesenheit von Leben nucleadora Kunsteisbahn, ebenso wie die Sicherheit in Pflanzen. Zusätzlich zu den Tests Pflanze, diese Belastung dort 8 gut wir 1ff8 tró Essenz der Toxizität bei Säugetieren, wie es wünschenswert ist. Die Wirksamkeit der biocontrol agent P.agglomerans EPS125 für die Hemmung P.expansum wurde durch Tests der Dosis, aus denen sie gewonnen Parameter der Effizienz. Genauer gesagt, nach dem Modell der hyperbolischen Sättigung strain EPS125 war sehr wirkungsvoll gegen P.expansum in Apfel zeigt durch eine wirksame Dosis von 2.7x10 (5) bis 7x10 (5) KBE / ml und einem Verhältnis von 25-101 Zellen zu inaktivieren EPS125 Streitigkeiten ein. Die Studie des Mechanismus beschäftigt P.agglomerans in biocontrol Kontrolle P.expansum wurde durch Annäherungen phänotypische und genetische Untersuchungen auf der Grundlage der Nutzung der Technik der Mutagenese mit Transposons. Nach den Ergebnissen der phänotypischen Charakterisierung, Herstellung von Antimykotika Metaboliten sowie Nährstoff für den Wettbewerb nicht zu den wichtigsten Mechanismen, die für die inhibitorische Kapazität der Belastung EPS125. Im Gegensatz dazu, direkte Interaktion zwischen Zellen biocontrol agent und Sporen des Erregers erforderlich ist, um die Hemmung der Keimung von Sporen EP.exampsum und die daraus resultierenden Infektion. Bemerkungen handeln Kulturpflanzen P.agglomerans EPS125 gewachsen und Apfelsaft zeigen, zusammen mit einer ganzen Reihe von Filament-wie Typ IV Pili Vernetzung von Zellen oder Vielzellern Cluster "symplasmata" eingehüllt in eine Schicht aus Alginat. Diese Beobachtungen deuten darauf hin, dass sowohl die Fäden, die sich für die Bewegung wie "zupfen" führt zu der Bildung von microcolonias, wie glinato, deren Herstellung ist beeinflusst durch die wachsende Bedingungen könnte intervenieren, in den frühen Phasen der Ausbildung Tabelle oder mikrobielle Biofilm von P.agglomerans EPS125, sowie spielt eine Schlüsselrolle in der Hemmung der Keimung der Sporen des Erregers. Um wirklich beweisen, was Mechanismus ist verantwortlich für die Aktivität biocontrolador der P.agglomerans EPS125 verwendet wurde genetischen Analyse von Mutanten defekt biocontrol in der P.expansum in apple, die durch zufällige Mutagenese mit minitransposón GUS (mTn5SSgusA40). So, 7 Mutanten völlig defekte in biocontrol von verrottendem blau (m40, m439, m622, m1212, m2002, m2126 und m4015 () wurden aus insgesamt 4032 Mutanten nicht auxotróficos. Dichois Mutanten zeigte eine ähnliche Morphologie der Kolonialzeit über dem Durchschnitt Minimum ABM; Wachstum Kurven in der Mitte LB Züge vermehrt Flüssigkeit in manaza zu 13 und 23 ° C, molekulare Signale aus Quorum sensing, Produktion und Qualität von Alginat. Phänotypischen Unterschiede in Bezug auf die Belastung nur beobachtet wurden in der Mutante m2126 und m4015 ableiten, die in Verbindung Protein hypothetischen In silico zeigte eine 35%-Sequenz mit maino Säuren Identität des Proteins dihidrodipicolinato sintas DHDPS verschiedener Bakterien. DHDPS ist ein zentrales Enzym in der Biosynthese von Fleisch-Route diaminopimelato (meso-DAP) in Bakterien und Pflanzen, das ist ein wesentlicher Bestandteil der Arbeit Wand peptidoglicano bakterielle und repercusores direkten Lysin. Aufgrund Mutante m40 ist nicht auxótrofo für Lysin und verfügt über die Route der DAP biosintética bleibt unverändert der Lage zu wachsen inmitten wenigstens hat drei eingefügt Transposons in seinem Genom-Sequenzierung und nucleítidca flanqueante die transposon zeigte keine Ähnlichkeit zu Sequenz, die derzeit in der Datenbank GEnBank, diese Mutante verworfen, da ein Kandidat zu sein als in dieser Arbeit. Hypothetische Proteine aus der Nukleotid-Sequenz der Mutante m2126 876 bis 1392 von 48 auf 753 b gemeinsamen Ähnlichkeit mit einem hypothetischen Protein mit bisher unbekannter Funktion Comamonas sp von 33% Eiweiß und der Familie der luciferasa bakterielle 55% zu belassen. Gemäß der Literatur und die Ergebnisse in diesem Papier, scheint alles darauf hinzudeuten, dass die Mutation in der Mutante m2126 verändert haben könnte ein luciferasa FMN-Verkäufer (LuxAB ) Verwandten Gen-Regulation-System via Quorum sensing möglicherweise bei der Herstellung von Fäden ähnlich denen Pili Typ IV und der anschließenden Bildung des Biofilms. Abgeleitet Proteinsequenzen aus mutierten m4015 zeigten 41% Identität mit Lysin / Ornithin-N-monoxigenasas an der Route der biosintética Sideróforos Typ aerobactina. Mutmaßliche transposón Insertion in der Mutante m4015 beeinträchtigt die Fähigkeit der dieses Element zu P.expasum, die unerlässlich ist, um den Prozess der Keimung der Sporen. Irgendwann, der Nukleotid-Sequenz der Mutanten m2002 und m4015 zeigte eine 90 % Sequenz Identität mit IS1222 Aufnahme, die durch Streichungen und Gross Translokationen genetischen Prozesse beitragen, die Flexibilität und Anpassung an die Umwelt. Trotz nucleotídicas, dass beide Sequenzen waren identisch, die Einfügemarke tranposón der in den beiden Mutanten war anders, weil die Muster, die in der Süd-und Fonotípicas Merkmale der beiden Mutanten nicht überein. Die Ergebnisse, die in diesem Papier ist es möglich, ein Szenario der Biofilmbildung in P.agglomerans EPS125, die sich an der Hemmung der Keimung der Sporen des Erregers. Erstens, die Zellen Antagonisten an der Wunde Oberfläche des Blocks mit einer Vielzahl von zellulären Komponenten wie Filament-wie pilil Typ IV algianto. Haartyp Diese Filamente binden könnte auf unterschiedliche Oberflächen einschließlich anderer Zelle sbacterianas und Sporen Erreger prudiciendo Mobilität rate "zupfen" durch Polymerisation Und Rücknahme der Filamente pilosos. Diese Bewegung Zellen über die Erleichterung der Bildung von Agglomeraten mutlicelulares, und schließlich microcolonias wo wären die Sporen des Erregers. Parallel dazu, die Einhaltung der ursprünglichen Zellen-Antagonisten ist, gefolgt von der Produktion von extrazellulären polsiacáridos l Art der Alginat, die induzierte nur unter bestimmten Bedingungen. Außerdem werden die Zellen EPS125 könnte durch ein halb-Capture-Eisen siderófors abnehmend ihre Verfügbarkeit für die pathogene Zellen zu verhindern und ihnen den Prozess der Keimung. Mikroumgebung der dann durch die Belastung reduzieren könnten, die EPS125 Verfügbarkeit der verschiedenen Verbindungen wie Wasser, Sauerstoff oder Eisen, die von wesentlicher Bedeutung für die Keimung von P.expansum bekannt. Außerdem ist die Belastung EPS125 produziert beteiligten Moleküle in der HSL Quorum sensing via Regulierung der Gene, die möglicherweise verantwortlich für die Differenzierung von Biofilm und seine Aktivität biocontroladora. Konkret könnte es in direktem Zusammenhang mit der Bildung von Filamenten pilosos wichtig, in den Prozess der Differenzierung der mikrobiellen Matten und andere Mechanismen biocontrol unbekannt Beschäftigten durch die biocontrol agent. Kurz, es Biofilm bilden P.agglomerans EPS125 bietet ein angemessenes Rahmenbedingungen für ihr Wachstum, ihre körperliche Struktur erlaubt widerstehen Umwelt-Stress und hemmt Infektion, die durch P.expansum entziehen Sporen wesentlichen Komponenten wie Wasser. Sauerstoff oder Eisen, die schießen den Prozess der Keimung. Abschließend werden die Ergebnisse, die in diesem Papier baut auf Wissen Das Verhalten von P.agglomerans in seiner natürlichen Umgebung zu stärken und die Eignung dieser Phase als eine interessante biopersticida um kommerziell entwickelt.