BACTERIAL PHYSIOLOGY

Auteur: MALLORQUÍ FERNÁNDEZ NOEMÍ.
Année: 2003.
Université: GIRONA [www.udg.es].
Lieu de l'exposition: CIENCIAS.
Lieu de préparation: FACULTAD DE CIENCIAS DE LA UDG.

Résumé: Ce document porte sur l'étude paartir différents niveaux de caroténoïdes espèces de bactéries brun Verts Soufre (GSB, les Anglais Green Sulfur Bacteria). L'objectif global a été de savoir ce que la fonction de ces pigments enestos micro-organismes ainsi que d'élargir la connaissance de sa structure et de ses entrcciones avec les otres les pigments photosynthétiques de l'appareil. Il ad'abord conçu une méthode cromotografía liquide haute rasolución (CLHP) pour anilizar pour plus de précision et rapidement carotenides de différentes souches de GSB (chapitre 3). Cette méthode est caractérisée par une purificaciín precvia d'extraits de pigments à travers les colonnes d'alumine à supprimer cateroclorofilas (BLLS). Cette permitó analysée avec une haute résolution et h. seulement 45 minutes. Des différents caroténoïdes par chromatographie en phase de carrière et de leurs précurseurs, ainsi que configuaraciones transeuropéens et cis leurs isómeros.El deuxième génétiques méthodes utilisées consistait en une modification du mode de Borrego et Garcia Gil (1994) et de permettre la séparation exige de tous les types de pigments , Tous deux de culrivos pur comme échantillon complexité. Un exemple concret est l'ancien sédiments dans la zone du lac de Banyoles. Dans ces sédiments (0,7-1,5 millions d'années antigà ¼ âge) detectron, entre autres pigments, les caroténoïdes spécifiques espèces de brun GSB, qui a confirmé la présence deestas bactéries dans la région du lac de Banyoles ya des Pléistocène inférieur. Ce premier chapitre a aussi analysé la caroténoïde de Cholrobium (Chl.) phaeobacteroides CL 1401 grâce à la chromatographie en phase liquide couplée à la spectrométrie de masaa (LC-MS/MS), afin de confirmer son identité et de son poids moléculaire. Nous avons également analysé l'effet de la température, de lumière et de différents oxydants et des agents réducteurs sur la xomposición quantitatives et calitativa de carotnoides et BCLS ce especie.Estos expériences permitieroon confirmer la photosensibles delas BCLS et des isomères trans / cis, de divers caroténoïdes ne sont pas produits au cours des artefacts La manipulation des échantillons, mais sont constitutifs de l'appareil photosynthétique de ces micro-organismes. Chapitre 4 comprend la physiologie des expériences réalisées avec certaines espèces de GSB, a porté sur l'élucidation des mécanismes dynamiques dans la synthèse des différents pigments (BCL antenne, BCL caroténoïdes par intérim) au cours de la croissance de ces espèces. Cette étude a également permis de suivre les variations du nombre de CR au cours du processus d'adaptation de luminance. Du cuantificaciín de BCL663, l'accepteur premier dans la chaîne de transport d'électrons en GSB, nous avons calculé le nombre de RC. L'estimation de la relation RC / clorosoma lieu, le premier à partir de données estequiométricos et biométriques présents à la bibligrafía puis de les données expérimentales de ce travail. Le vuen ajustement entre les différentes estimations donnent force pour estequiométrico valeur calculée, qui était en moyenne d'environ 70 CR par clorosoma. Dans ce chapitre de la physiologie aussi étudié variriones dans les relations transeuropéens / cis- caroténoïdes entre les principales espèces de brun GSB.Las les relations calculées pour culrivos pas resentaron différences souligné en termes de conditions d'éclairage de ces. Dans les deux conditions étudiées, haute et basse intensité lumineuse, la valeur de la relation transport / cis- était aproxomadamente, 2. En clorosomas isolés des différents cepar brun GSB également la relation était d'environ 2, tant pour le isorenierateno (Isr) et le B - isore 8 niearate 5cc pas (B - Isr). Dans les populations naturelles de Chl. Pheobacteroides cette relation est aussi 2 isomères trans cis- isomère pour chacun, en gardant à la fois la profondeur et constantes dans le temps. Enfin, dans le chapitre 5 présente un marqueur moléculaire qui ont permis l'identification de certaines espèces de brun GSB. Malgré sa conception initiale était fondée sur un gène impliqué dans la synthèse des caroténoïdes (crtY, qui encode une paire licopeno cyclase) la dernière séquence à partir de laquelle nous avons obtenu la encebadores sélective est ralcionada avec la famille de protínas du Policétido - ceto - sintasas (PKT). Néanmoins, le nouvel outil peut être très utile pour distinguer les espèces brun GSB égard de la verdure dans les populations mixtes comme celles trouvées dans les milieux naturels et ouvre la porte à de futures écologie microbienne expériences utilisant des techniques telles que la PCR en temps réel, ce qui permettrait de contrôle sélectif De polblaciones espèces brun GSB en ecositemas naturelles.

Auteur: AZUA PEREZ IÑIGO.
Année: 2004.
Université: PAÍS VASCO [www.ehu.es].
Lieu de l'exposition: FACULTAD DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA.
Lieu de préparation: FACULTAD DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA.

Résumé: Les agrégats marins, omniprésent et d'une origine différente, sont riches en matières organiques et fortement colonisée par des micro-organismes. Ils ont retiré les moyens par désintégration physique, sédimentation différentielle et décomposition biologique, et en participant à l'après-vente, et de la décomposition de la matière organique sédimentation dans la mer. La décomposition procariótica inclut la respiration, la production de biomasse et / ou de solubilisation agrégat. Les deux habitats, et a ajouté en phase liquide, a présenté deux communautés procarióticas, vivre libre et collé avec différents morphologiques, physiologiques et taxonomiques. L'objectif du présent document est d'analyser l'organique de décomposition procariótica de granulats marins. On étudie actuellement coincé dans procaryotes et de vie primaire gratuit hydrolytique attaque, l'incorporation de matières organiques libérés et la production de biomasse. Il traite de trois types d'agrégats: des agrégats oligotrophes eaux marines et deux types d'agrégats formés dans le laboratoire, des agrégats et naturel fitoplanctónicos. L'agrégat fitoplanctónicos, avec abondance de composés facilement utilisable, de simuler formés au cours de la croissance massive fitoplanctónico. L'exercice de simulation naturel de gregados pauvre et plus réfractaires formé par l'agrégation des différentes particules marines. Les deux procaryotiques diffèrent dans l'hydrolyse dans la fabrication de composés organiques. Le vivant en liberté exprime des enzymes hidrolíticos et des systèmes de transport avec une plus grande affinité dues à la rareté des nutriments. Ces différences expliquent la cinétique multiphasiques observées dans les systèmes marins. Dans l'ensemble fitoplanctónicos la procariota faire profiter de son adhérence supérieure grâce à l'hydrolyse, tandis que les agrégats naturels, les plus pauvres, il n'ya pas de différences entre procaryotes. Dans le procariota adhéré eaux oligotrophes présente haut ne prend que peu de particules de liquider et vraisemblablement nouvellement formé. Dans l'ensemble fitoplanctónicos et naturelles, il ya une stratégie d'adaptation, baisse de l'absorption et l'augmentation de l'affinité, car elle accroît le degré de colonisation et d'appauvrir quantitativement et qualitativement agrégats. Les agrégats sont des centres de haute activité, et une forte croissance procaryotiques que récemment formé. Comme nous sommes colonisés et dégradées se produisent des changements chimiques et cessera d'être un jour favorable l'habitat. Dans l'ensemble fitoplanctónicos nouvellement formé par hydrolyse et les processus de fabrication sont couplés. Toutefois, au cours de sa décomposition est découplée en diminuant faire tout en restant élevé hydrolyse. En raison de desacomplamiento est solubilizan composés organiques dans la phase liquide en favorisant le développement de la vie communautaire gratuit. Ainsi, les agrégats marins agissent comme des enzymes qui libèrent des réacteurs de la matière organique au cours de sa déposition, qui devrait aider à expliquer les taux de croissance atteignant procaryotiques la vie libre.

Auteur: JIMÉNEZ BELENGUER ANA ISABEL.
Année: 2004.
Université: POLITÉCNICA DE VALENCIA [www.upv.es].
Lieu de l'exposition: Dep. Biotecnologia.
Lieu de préparation: Universidad Politécnica de Valencia.

Résumé: Sexe Helicobacter comprend 23 espèces de bactéries microaerófilas. Le plus étudié est la bactérie Helicobacter pylori, qui est responsable de 90% de tous les ulcères gastroduodénaux et étroitement liée au développement du cancer de l'estomac. Les mécanismes de transmission de cet organisme ne sont pas tout à fait certain. Leur présence a été détectée dans les matières fécales, d'eau potable, de lait et de légumes, mais en très petit nombre de cas a été isolé. Il a été récemment suggéré, en outre, que la bactérie Helicobacter pylori peut être résistants à l'ozone, les concentrations de chlore et utilisés pour potabilizar distribution de l'eau. En outre, des études expérimentales ont montré qu'en termes de stress environnemental ces micro-organismes peuvent entrer dans une phase réalisable, mais non arables (VNC), qui, en dépit de ne pas pouvoir être récupéré, conserves diverses activités métaboliques et expriment des facteurs de virulence. L'induction de cet état VNC, qui est accompagnée de changements morphologiques (passage à la forme cocoide) a été proposée comme mécanisme possible pour la survie dans l'environnement, ce qui favoriserait sa transmission. Ce document a étudié la survie d'une souche de H. pylori appartenant à la collecte, dans les différents modèles à différentes températures aquatiques microcosme. On a constaté que les cellules de H. pylori conservés dans un tampon de phosphate salin PBS à 11Â ° C, sont cultivées pendant 12 jours, alors que dans l'eau chlorée non à la même température, arables restera jusqu'au 5 jours. Aussi, à des températures plus basses l'cultivabilidad en PBS persiste plus longtemps, et les cellules sont cultivables détecté jusqu'à ce que les 22 jours. Nous avons également noté l'existence d'une hélice non arables viables tant dans les eaux de surface et PBS. Exposition. Tout au long de l'étude, tous microcosme resté constant divers paramètres, tels que les ARNr et de l'ADN contenu, ainsi que la production de l'uréase et de la catalase, les enzymes associées à la virulence. Ces résultats témoignent de la présence continue de cellules viables non arables (VNC) de H. pylori dans les systèmes aquatiques sur de longues périodes. Une des plus grandes préoccupations est de savoir si ces formes sont potentiellement infectieux. Cela implique de déterminer la capacité de ces cellules à cultiver à nouveau. La poursuite de la croissance des médias qui permet de récupérer ce microorrganismo votre état VNC est également crucial de leur isolement par rapport aux échantillons environnementaux. Dans ce travail, nous avons testé 15 milieux de culture, afin de déterminer si H.pylori cellules dans un état VNC recouvrer leur capacité de réplication. Bien qu'elle ne pouvait pas être récupéré par la culture plaque, les résultats montrent la persistance de formes viables dans tous les pays, même 14 jours après son éclosion, qui indca maintenir un potentiel métabolique.

Auteur: Hernández Romero Diana.
Année: 2005.
Université: MURCIA [www.um.es].
Lieu de l'exposition: Facultad de Biología. Universidad de Murcia.
Lieu de préparation: Facultad de Biología.

Résumé: Le polyphénol oxidasas (PPO) sont des enzymes qui phénols oxydés en utilisant l'oxygène. Ils sont répartis en lacasas et tirosinasas et enzymes sont d'un grand intérêt à la fois des biotechnologies (pour utilisation dans les produits de dégradation récalcitrants, dans l'industrie du papier, les colorants et pigments, etc ...) pour leur implication dans la biosynthèse melaninas qu'en général, ils sont noirs ou Les pigments bruns impliquée dans de nombreux rôles, la plupart d'entre eux pour se protéger. Ont été retrouvés dans le génome de Ralstonia solanacearum potentiel jusqu'à quatre gènes qui peuvent coder les enzymes avec PPO activité. Parmi les objectifs de la thèse de doctorat souligne la détection et l'optimisation de ces activités dans R. Solanacearum PPO, mutagenèse potentiel de gènes responsables de l'activité et de la purification et la caractérisation des enzymes avec PPO activité. Un autre objectif sera basée sur une évaluation des effets de l'addition de phénols dans la physiologie de R. Solanacearum ainsi que l'impact potentiel sur l'infectiosité des mutants par rapport à la souche sauvage. Grâce à la construction du nul grâce à la recombinaison homologue des mutants nous avons le gène impliqué dans les diverses activités qui pourraient encoder PPO. Une fois obtenue extraits cellulaires de ces mutants regarder la perte d'une activité spécifique PPO associés à chacune des gènes mutés, qui n'a toutefois pas d'accord avec l'approbation préalable de ces produits de gènes, afin que nous proposons une modification de la nomenclature d'eux-mêmes, de façon Que le produit du gène RSc0337 est un tirosinasa, gène RSc1501 est un catéchol et oxydase gène RSp1530 encode une laccase. Il a rejeté l'étude du gène RSp0656 par coder une protéine de la résistance au cuivre CopA et donc de ne pas encoder une PPO. Il s'est d'épuration de produits protéicos de ces gènes, ainsi que d'une caractérisation biochimique et cinétique de la même observé dans le cas de tirosinasa une plus grande affinité pour la tyrosine que la dopa, ce qui a conduit à l'élaboration d'un brevet par notre groupe sur le processus d'obtention L - La dopa utilisant tirosinasa R. Solanacearum. Un autre résultat important est observé lorsque adicionamos composés phénoliques dans les cultures R. Solanacearum, où l'on voit une plus grande sensibilité à leur mutants affectés dans la PPO, ce qui suggère une implication de ces processus de désintoxication de ces composés, processus qui pourrait avoir une explication physiologique Dans la défense de la bactérie avant l'attaque de l'usine qui produit ces composés comme une réponse au stress différents, tels que l'infection par un agent pathogène. En outre, nous avons également pu observer la synthèse de melaninas et autres pigments associés aux activités PPO dans R. Solanacearum. Enfin, nous n'avons pas été en mesure de démontrer une perte de l'infectiosité associée à l'absence de toute concrètes PPO, qui en principe pourrait être expliqué par le fait que le processus infectieuse multifactorielle est un processus où l'affection d'une PPO ne pouvait ocasonar effet phénotypique floues que D'être visible sur un essai de pathogénicité qualitatifs.

Auteur: URETA BARRIOS ANA CLAUDIA.
Année: 2005.
Université: POLITÉCNICA DE MADRID [www.upm.es].
Lieu de l'exposition: ESCUELA TÉCNICA SUPERIOR DE INGENIEROS AGRONOMOS.
Lieu de préparation: ESCUELA TECNICA SUPERIOR DE INGENIEROS AGONOMOS.

Résumé: La symbiose Rhizobium-leguminosas il ya deux enzymes clés impliquées dans le métabolisme de l'hydrogène moléculaire (H2): nitrogesanas et hydrogénase. Le nitrogenasa catalyse la réduction de l'azote atmosphérique à l'ammoniac, ce processus implique la production d'hydrogène. Le gaz hydrogène se perd car il s'agit d'un gaspillage d'énergie dans le processus de fixation de l'azote. Le hidrogenasas catalyse l'oxydation de l'hydrogène moléculaire protenes. Électrons de l'oxydation de l'hydrogène entrant dans la chaîne respiratoire jusqu'à accepteur final est l'oxygène, et ce processus peut être couplé à la production d'énergie (Ruíz-Argà ¼ So et al, 2000). Le recyclage de l'hydrogène a été associée à une augmentation de la productivité de l'usine en raison de l'accroissement de l'efficacité énergétique dans la symbiose Rhizobium-leguminosas. L'hydrogénase est une enzyme heterodimérica que cette couplée à la membrane et contient un actif bimetálico [NiFe] dans la plus grande unité. L'incorporation du nickel dans le coeur de la hydrogénase active est une étape essentielle dans la synthèse de l'enzyme. Il a été établi que la disponibilité de nickel limites de l'expression de l'hydrogénase niveau de la sous-unité de traitement de l'enzyme. Il a été établi que la disponibilité de nickel limites de l'expression de l'hydrogénase niveau de la sous-unité de traitement de l'enzyme dans les plantes cultivées dans la vermiculite (Brito et al, 1994), mais on ne sait pas si cette limitation existe dans des conditions naturelles de culture. Les objectifs de cette thèse sont les suivants: 1-Pour analyser le niveau de nickel sol comme un facteur limitant dans la mesure du possible, l'expression du travail hydrogénase activité dans les sols agricoles pour la présente étude, nous avons exploré l'effet de l'addition de nickel dans le sol. Nous avons choisi 6 sols agricoles représentant de la Communauté de Madrid qui ont identifié leurs caractéristiques physico-chimiques. Ces sols ont été utilisés comme substrat pour la croissance de pois (Pisum sativum) inoculés avec une souche hydrogénase R.leguminosarum positif. L'analyse de l'hydrogène dans le métabolisme de ces plantes Bacteroides montré que ni présents dans ces sols ne suffit pas de recycler 100% de l'hydrogène produit dans le processus de fixation de l'azote. Comme une stratégie visant à surmonter la limitation de nickel a été utilisé par une souche plus efficace de recyclage de l'hydrogène. Ces résultats ont été corrélées avec les tests inmunodetección où nous avons exploré l'effet de nickel dans la poursuite de la plus grande unité de l'hydrogénase et a vu que le traitement enzymatique dépend du niveau de nickel dans le sol. Les résultats indiquent que les faibles niveaux de nickel provenant des sols sont un facteur limitant pour l'activité hydrogénase dans la symbiose R.leguminosarum-guisantes. 2-Pour évaluer les avantages associés à la présence d'hydrogénase en inoculators rizobaianos. Pour évaluer les avantages associés à la présence d'hydrogénase en inoculators rizobianos, un système intégré hop du Rhizobium leguminosarum bv viciae souches hydrogénase négatif noduladoras de temps (Vicia sativa), en utilisant un minitransposón (TnHB100, Báscones et al, 2000). Ce système a permis d'intégrer dans un groupement hop stable dans le génome de la bactérie récepteur. Nous avons sélectionné deux souches avec des inserts situés dans des sites non pertinents et analysé le génome hydrogénase activité et le comportement de symbiose. L'une des souches ont montré des augmentations importantes de l'accumulation d'azote associé présence de la capacité de recyclage de l'hydrogène. 3-Pour effectuer une analyse comparative des génomes de souches de Rhizobium leguminosarum capable d'exprimer le système hydrogénase. La comparaison a été effectuée R.leguminosarum UPM791 génotypique des souches, le titulaire du système hop et 3841, dont le génome a été séquencé, en utilisant 8 microarr 426 ope ADN générées par la souche 3841. Préalablement à l'étude comparative vérifié que le système hop s'exprime correctement dans la souche de 3841. La comparaison a montré que 78% des gènes ont été conservés dans les deux souches, ce qui indique que ces microaarays sont utiles pour l'analyse des facteurs impliqués dans le contrôle de l'expression de l'hydrogénase de UPM791.