VIROLOGIE

Auteur: MORILLA VAZQUEZ GABRIEL.
Année: 2003.
Université: MÁLAGA.
Lieu de l'exposition: FACULTAD DE CIENCIAS.
Lieu de préparation: FACULTAD DE CIENCIAS.

Résumé: La maladie est causée par plusieurs espèces de begomovirus: virus de la chaîne d'ADN facilement transmis par l'aleurode Bemisia tabaci Genn. Dans le bassin méditerranéen, deux espèces provoquent des maladies: la tomate jaune feuille de curl virus de la Sardaigne (TYLCSV et de la tomate de curl virus de la feuille jaune (TYLCV - Mld). TYLCSV ad'abord été décrit comme un agent étiologique de grandes pertes dans le sud de l'Espagne dans les cultures de tomate en 1992 . Le deuxième type virual, TYLCV, a été détectée en 1997. Cultures de tomates sont souvent des plantes qui sont infectés par les deux souches du virus. Afin d'analyser l'impact potentiel de ocexistencia de ces deux virus, ont été infectées en laboratoire plants de tomates et N . Benthamiana avec les deux souches. Le montant de l'ADN viral qui accumule était la même que celle qui apparaît dans le simple infection. Hybridation in situ des tissus infectés a été montré que le virus a été constaté que dans le phloème dans les deux espèces végétales. Cette Distribution n'est pas modifié lorsque le virus injecte la fois sur le même étage. Proportion des noyaux contenant de l'ADN viral était la même dans les plantes infectées par TYLCSV, TYLCV ou les deux. Hybridation de noyaux isolés à partir de plants infectés par les deux virus, a révélé qu'au moins un Cinquième des noyaux contenant de l'ADN de ces deux espèces virales. Le nombre élevé de co-infection noyaux pourrait expliquer pourquoi la recombinaison entre différentes espèces de geminivirus est si répandue. Dans une deuxième partie des travaux a été constaté que les plants de poivron (Capsicum annuum) Collectés dans des cultures dans la province d'Almeria, sont infectés par deux souches de TYLCV: TYLCV - Mld (qui ne sont pas décrites plus tôt dans la péninsule ibérique) et TYLCV. Infectieux clones ont été obtenus à partir des deux souches du virus et a analysé la susceptibilité des Poivre plantes, N.benthamiana, de haricots et de tomates à ces deux virus mediant. Les résultats indiquent que les deux isolats sont capables d'infecter le poivre. Dans la dernière partie du travail que nous avons mis au point une cassette contenant l'expression GFP éléments bengomovirus monopartito TYLCSV. Avec cette De construction ont été obtenus plantes N.benthamiana contenant une seule copie de la bande se compose d'un stable dans son génome. Lorsque ces plantes transgéniques sont infectées par TYLCSV se produire des copies extracromosomicas du transgène d'être retenus comme episomas. Forming episomas corrélée avec une modification de la configuration D'expression des GFP dans ces plantes. Eu une augmentation de la fluorescence verte les veines de toutes les feuilles qui sont au-dessus du point d'inoculation, et le transport dans les tissus des racines et des pousses. Conséquent, ce système pourrait être utilisé pour détecter la réplication TYLCSV lors de la Plante, et d'identifier des protéines nécessaires à l'apparition de cellules de l'infection. Pour confirmer cette hypothèse, nous réduit au silence par VIGS PCNA (antigène nucléaire des cellules en prolifération). Inhibicón de PCNA empêché le changement dans l'expression de la GFP, et de réduire l'accumulation de virus.

Auteur: GUIX ARNAU SUSANA.
Année: 2003.
Université: BARCELONA.
Lieu de l'exposition: FACULTAD DE BIOLOGÍA (ub).
Lieu de préparation: UNVIERSIDAD DE BARCELONA.

Résumé: Les astrovirus sont certains virus icosaédricos petits avec un génome à ARN de polarité positive monocatenario et 3 modes de lecture ouvert (ORF1a et ORF1b de protéines non structurelles, et pour les protéines structurales ORF2). Considéré comme la troisième cause de la non-bactérienne de gastro-entérite chez les enfants comme chez les adultes. Dans cette thèse, est caractérisé une des protéines non structurelles du virus codé par le ORF1a, protéines nsP1 / 4. L'utilisation d'une souris d'anticorps polyclonaux produits dans le laboratoire contre le peptide de synthèse correspondant à la région hidrofílica plus de la protéine, a découvert que la protéine nsP1 / 4 a un poids moléculaire compris entre 24 et 26 kDa, qui s'accumule dans la région périnucléaire colocalizando À l'ARN viral et membranes du réticulum endoplasmique, et qu'il risque de subir de multiples modifications post-traduccionales par glycosylation et / ou la phosphorylation. En outre, il a également marqué la variabilité génétique d'une région hipervariable contenue dans la protéine nsP1 / 4 et de la variabilité des capacités différentes de reproduire le virus, ainsi que les différents types de particules virales dans les selles d'enfants infectés. Par conséquent, une relation indirecte entre une variable nsP1 / 4 et potentiellement pathogènes viraux propriétés. Les principales caractéristiques de cette variabilité génétique sont la présence de nombreuses insertions et les délétions brut qui préservent le schéma de lecture et d'une haute tolérance aux substitutions d'acides aminés. Étant donné l'importance de cette relation entre la variabilité de la protéine nsP1 / 4 et propriétés potentiellement virulente du virus, a développé un système de diagnostic et de la dactylographie par RT-PCR et de l'analyse du polymorphisme longueur des fragments (RFLP) limité à astrovirus et appliqué cette méthode dans un grand Échelle étude épidémiologique sur 3 ans sur la population pédiatrique dans la région de Barcelone. L'incidence des astrovirus observée était de 4,9% et de 3,6% pour genogrupos A et B respectivement, et le taux de détection est plus élevé chez les enfants entre 2 et 4 ans. Il y avait une distribution semestrielle et une augmentation de l'incidence des infections astrovirus pendant les mois d'hiver. Il a également été noté que l'incidence de chaque sérotype et chaque subgenotipo varient chaque année, ce qui suggère qu'il n'ya pas d'immunité croisée entre les différents sérotypes. Enfin, nous avons exploré quelques-unes des relations qui se produisent entre le virus et la cellule hôte en utilisant intestina lignée cellulaire humaine CaCo-2 et a été considérée comme une réponse des cellules apoptotiques développés après l'infection astrovirus. La caractérisation de cette réponse apoptotique permis à dire que le pourcentage de cellules apoptotiques est directement proportionnel à la multiplicité d'infection utilisée et qu'il ya un lien direct entre l'expression des protéines non structurelles du virus encodé par le ORF1a et de l'apoptose. Il identifie un domaine potentiel de la mort de domaine (DD) dans la protéine nsP 1a / 4 du virus. Enfin, il identifie l'activation de la caspase 8 dans l'induction de l'apoptose et présente un modèle pour expliquer la signification biologique de cette induction de l'apoptose par le virus, ce qui suggère que l'apoptose est nécessaire à la bonne maturation des protéines de la capside.

Auteur: TAPIA SECO NATALIA.
Année: 2004.
Université: AUTÓNOMA DE BARCELONA.
Lieu de l'exposition: HOSPITAL UNIVERSITARI GERMANS TRIAS I PUJOL.
Lieu de préparation: ESCUELA DE POSTGRADO.

Auteur: CARMONA HIDALGO ROCÍO.
Année: 2004.
Université: COMPLUTENSE DE MADRID.
Lieu de l'exposition: FACULTAD DE MEDICINA.
Lieu de préparation: INSTITUTO DE SALUD CARLOS III.

Résumé: Cette thèse doctorale démontre pour la première fois l'existence et la fréquence de la résistance naturelle à la nouvelle inhibiteurs de la fusion chez les patients infectés par génétiques différentes formes de VIH - 1 et ainsi démontrer l'importance des cuasiespecies virales réservoirs variantes impliqués dans la réponse à la thérapie avec de nouveaux fámacos. On notera également la détection de nouvelles mutations dans HR2, en plus de celles déjà éprouvées dans HR1 et de sa relation avec un échec virologique, suggérant son rôle potentiel dans la résistance à la drogue et à poser pour l'optimisation du traitement par les inhibiteurs de fusion serait commode d'étudier la résistance De la même manière que se font maintenant dans le cadre de la transcriptase inverse et inhibiteurs de protéase.

Auteur: CANO CEJAS IRENE.
Année: 2004.
Université: MÁLAGA.
Lieu de l'exposition: FACULTAD DE CIENCIAS.
Lieu de préparation: FACULTAD DE CIENCIAS - UNIVERSIDAD DE MÁLAGA.

Résumé: La maladie linfocitis produit dans de nombreux foyers épizootiques espèces de poissons cultivés d'entre eux est d'or (Sparus aurata L.), l'un des plus importants sur le plan économique espèces dans la Communauté autonome Andaluza. L'agent étiologique de cette maladie est le virus de la maladie linfocsitis (LCDV), un membre du genre Lymphocistivirus, l'un des quatre genres actuellement décrites dans la famille Iridoviridae. La détection de LCDV limiter à l'élaboration des normes techniques dans la culture de lignées cellulaires, et la détermination ultérieure par le biais de techniques sérologiques virales. Cette méthode a été appliquée uniquement pour confirmer le diagnostic de maladie dans les poissons et semble avoir une application limitée en raison principalement de sa faible sensibilité. L'objectif de ce travail a été l'élaboration et l'évaluation des méthodes de diagnostic pour la détection spécifique et sensible LCDV en or cultivées, et de l'application de ces méthodes dans l'étude de la pathogenèse de la maladie. Les techniques de détection développés sont appropriées pour l'identification précise des animaux malades dans LCDV (et inmunoblot en tache d'hybridation), comme pour la détection du virus chez les porteurs asymptomatiques (PCR nichée suivie par hybridation tache en confirmant le diagnostic). Les résultats obtenus dans les études de la pathogenèse révéler caractère persistant de l'infection, ainsi que la prévalence de l'infection asymptomatique des populations de doré cultivé. En outre, il a été déterminé que le LCDV produit une infection systémique de l'or, comme en témoigne la détection du virus dans différents organes analysés.

Auteur: ACOSTA GALLO BELÉN.
Année: 2005.
Université: COMPLUTENSE DE MADRID.
Lieu de l'exposition: FACULTAD DE CIENCIAS BIOLÓGICAS.
Lieu de préparation: UNIVERSIDAD COMPLUTENSE DE MADRID.

Résumé: Le carbone de la biomasse végétale est de l'appui de l'énergie stockée en continu la biosphère. La préoccupation sociale de la destruction des forêts et l'utilisation de combustibles fossiles ont à voir avec l'épuisement de cette énergie et de la libération d'oxyde de carbone dans l'atmosphère. Le carbone doit être absorbée par les océans et les continents, mais l'importance relative de chacun de ces puits, à la fois de sa répartition géographique que les mécanismes en cause, n'ont pas été faciles à quantifier à ce stade. Dans ce contexte, des systèmes pastoraux fournissent des données roman d'un grand intérêt. La nouveauté d'explorer les relations d'interdépendance révision des systèmes de pâturage Méditerranée est évident, peut être comparé avec d'autres systèmes par les pairs, tels que les forêts tropicales, pour lesquelles il a été suggéré comme un rôle important en tant que puits de carbone. Cette étude consacre une grande partie de son attention à comparer aériennes et biomasse souterraine accumulée dans la prairie dans des conditions environnementales différentes. Il était considéré comme un gradient de la disponibilité de l'eau naturelle, à la fois en altitude, l'humidité et la température variación-as-géomorphologique des zones d'exportation et de l'accumulation dans le coteau-gradiente. Dans les cas qui ont été renvoyés à l'herbe est le sujet de la consommation traditionnelle par les herbivores et a également simulé l'abandon par son pilote initiale exclusion du bétail dans toutes les positions et géomorphologiques hauteurs étudiées. Dans les prairies considérées dans la présente étude, la biomasse accumulée augmente avec la diminution du stress hydrique, ce qui conduit à enregistrer plus de 50 t / ha. Biomada Les eaux souterraines constituent la principale réserve de carbone accumulé dans la plante de performance, ce qui représente 90% de la biomasse végétale. Plus de 80% de cette biomasse souterraine est dans le top 10 cm de terre.

Auteur: SIERRA GARCÍA MARÍA.
Année: 2005.
Université: COMPLUTENSE DE MADRID.
Lieu de l'exposition: FACULTAD DE MEDICINA.
Lieu de préparation: FACULTAD DE MEDICINA.

Résumé: Le sida est causé par deux rétrovirus appartenant à la sous-famille de le lentivirus, le VIH - 1 et VIH - 2, dans laquelle le VIH - 1 présente la distribution mondiale. Le virión VIH - 1 contient deux copies d'ARN génomique et la protéine virale associée à une capside et entourée d'un lipide s'empêtrer dans lequel ils résident glycoprotéines virales et de la cellule hôte. La forte variabilité présente VIH - 1 est due à une combinaison de plusieurs facteurs qui permettent de mettre en évidence la fréquence élevée de recombinaison, qui est une partie intrinsèque du cycle replicativo de rétrovirus car chaque virión contient deux génomes viraux qui peuvent servir alternativement moule pour IT durant La synthèse de l'ADN proviral. Son importance dans le VIH - 1 peut être vu de plus en plus à l'augmentation de la détection des formes recombinantes dans plusieurs régions du pays. Neuf ont été définies à l'intérieur du groupe M sous-types du VIH - 1, chacun d'eux a un élément géographique, mais toutes sauf B sont représentés en Afrique centrale. Dans les zones où circulent les différents sous-types du VIH - 1, peut causer des formes recombinantes intersubtipo chez les individus infectés par deux ou plus de deux différents sous-type de virus, qui deviennent circulant lorsque les individus sont isolés dans trois différentes sans lien épidémiologique (CRFs). Prenant en compte les implications de la diversité génétique du VIH - 1 en général et la recombinaison en particulier, les objectifs qui se posent à cet thèses sont les suivants: 1 - Analyse des structures dans le virus de la mosaïque génomes recombinants intersubtipo BF Amérique (ou d'Amérique du Sud Origine) et BG Cuba. 2 - Etude de potentiel relations phylogénétiques entre eux et avec d'autres recombinants décrits dans la littérature. 3 - Identifier de nouvelles façons reconviertes circulant. 4, - Etude de la répartition des points de recombinaison le long du génome. 5 - Identification de la mère de recombinaison de souches analysées. Nous avons analysé 37 échantillons: 8 du Brésil, 5 de l'Argentine, 3 pour le Chili, 1 au Venezuela, 13 à Cuba et 7 de l'Espagne. La méthodologie est résumée ci-dessous: extraction de l'ARN ou ADN plasmatique de cellules mononucléaires du sang périphérique, amplifiée par PCr génome presque complet avec 4 fragments de solapantes et séquençage. Analyse phylogénétique par la méthode des bootscanning et arbres phylogénétiques utilisant MEGA et Puzzle. L'analyse phylogénétique de recombinants BF Brésiliens indiquer une origine possible indépendants les uns des doubles, des infections chez les individus sous-type ByF, et qui n'ont pas de lien avec l'CRF12_BF circulant en Argentine. Le BF recombinants du Brésil présente une fréquence variable points de recombinaison intersubtipo long du génome, avec une augmentation de la fréquence de la recombinaison dans le segment 5 'pôles et env mineur. Le reste de recombinaison de BF, à l'exception de P526, A068 et X1679 sont phylogénétiques liées à la CRF12_BF comme en témoigne la recombinaison des points communs, les regroupements dans les arbres phylogénétiques de représentants de sous-type F et de la présence de nucléotides et des acides aminés caractéristique de cette manière. Deux des recombinants analysés, a présenté une seule recombinaison de l'ouvrage, qui est similaire mais non identique à la CRF12_BF, et regroupées dans des arbres phylogénétiques entre les séquences partielles, qui pourraient représenter un nouveau CRF mais il serait nécessaire de caractériser une troisième avec un Structure identique à recombinants capable de le définir. L'examen des structures et des recombinants lso analyse phylogénétique suggère un modèle de la génération recombinante BF (y compris CRF12_BF), en Argentine et, éventuellement, dans d'autres pays de l'Amérique latine (sauf le Brésil) par recombinaison avec le virus de sous-type successives Bu 8 autres -r 78b ecombinantes BF long de différents scénarios de Un ancêtre commun, probablement d'origine brésilienne. Le VIH - 1 à Cuba se caractérise par un large éventail de solutions parmi lesquelles il faut insister sur deux nouvelles CRFs d'origine africaine (CRF18_cpx et CRF19_cpx) et un grand nombre de recombinaison uniques, en plus de Cubains Par G. Les résultats permettent D'identifier trois nouveaux CRFs à Cuba, qui se sont récemment à La Havane du homosexuels, qui sont passés de 0% à des infections diagnostiquées en 1999 à 31,4% dans ceux diagnostiqués en 2003. Ces trois nouveaux CRFs sont recombinés entre sous-type B (2 du virus) et G (3 virus), 3 présente 5 points de recombinaison en commun et tombent dans les arbres phylogénétiques des séquences partielles, ce qui indique une éventuelle origine commune. La grande diversité génétique du VIH - 1 a détecté à Cuba est sans précédent en dehors de l'Afrique centrale, et fait de ce pays un endroit approprié pour l'étude des implications de la diversité génétique du VIH - 1, y compris la recombinaison, la pathogenèse, la transmission, la réponse immunitaire protectrice Et les réponses à la thérapie antirétrovirale.

Auteur: RICO TORTOSA PATRICIA MARÍA.
Année: 2006.
Université: POLITÉCNICA DE VALENCIA.
Lieu de l'exposition: Dep. Biotecnologia.
Lieu de préparation: Universidad Politécnica de Valencia.

Résumé: L'objectif général de cette thèse a été de passer en revue les relations structure-fonction du virus briser la couleur de la fleur de Pelargonium (Pelargonium fleur briser les virus, PFBV), l'un des virus pathogènes les plus prévalant espèces du genre Pelargonium. Comme première étape dans la réalisation de cette analyse, on a déterminé la séquence complète des nucléotides de l'ARN viral génomique (gRNA), qui se compose de 3923 nucléotides (nt), et contient cinq modes de lecture ouverts (ORFs). Le FRO rapprocher de l'extrême-5 ', ORF1, codant pour une protéine de 27 kDa et se termine par un codon ambre lecture à travers laquelle de poursuivre la traduction au codon stop de ORF2 résultant en une protéine de 86 kDa qui contient les raisons Préservé l'ARN polymérase virale ARN-dependientes (RdRps). Deux petites ORFs, situé dans la partie centrale du génome viral, codent des polypeptides 7 (p7) et 12 kDa (p12), respectivement, qui sont probablement impliqués dans la circulation virale. De façon significative, la p12 présente un motif de grille de leucinas qui n'a pas été précédemment décrits dans des protéines. La 3'-proximal ORF codant pour une protéine de 37 kDa couvrir virale (COP). Le gène p12 est de la même tendance de la lecture que l'ORF qui conduit à la p86, ce qui pourrait se produire par un double processus de la lecture par le biais qui conduirait à une protéine de 99 kDa (p99). Une analyse comparative des séquences a montré que la p86, p12 et p7 montré supérieur homologie avec des produits équivalents du virus de la marbrure des Œillets (virus de la marbrure des Œillets), qui avec d'autres carmovirus, tandis que le p27 et de la COP ressemblait plus une protéine associée virus Saguaro cactus (Saguaro Cactus virus). L'analyse phylogénétique a confirmé détachement définitif PFBV sexe Carmovirus.

Auteur: VEGA MARTIN LAUREANO DE LA.
Année: 2006.
Université: CÓRDOBA.
Lieu de l'exposition: FACULTAD DE MEDICINA.
Lieu de préparation: FACULTAD DE MEDICINA.

Résumé: Dans cette thèse, nous avons abordé le problème de latence virale, la recherche de nouvelles protéines cellulaires impliquées dans la création et l'entretien de dormance. Nous présentons ici protéines de découpe et oliadenilación CPSF3 comme un nouveau répresseur transcriptionnel du VIH - 1. Nous avons décrit cette nouvelle activité répresseur de la protéine et d'un nouveau site d'interaction CPSF3 avec modulation de la région promoteur du VIH, nous proposons est responsable de son activité répresseur. Cette nouvelle activité se retrouve à la fois dans transitoire transfections comme un modèle de latence virale dans laquelle le virus est définitivement intégré et inactif. Comme il est indiqué que la protéine virale Tat augmente l'expression de CPSF3, nous avons étudié la capacité de Tat pour réglementer cette nouvelle activité, en voyant que la présence de Tat perdu répression médiatisée CPSF3. Il explore également l'interaction physique entre CPSF3 et de la protéine virale Tat. Etaient également présents, de protéines HIVEP - 3 et son rôle de répresseur de la transcription du VIH - 1, quel que soit son célèbre capacité à rejoindre les sites B.