MOLECULAR PHYSICS

Auteur: PÉREZ RUIZ RAÚL.
Année: 2006.
Université: POLITÉCNICA DE VALENCIA.
Lieu de l'exposition: U.P.Valencia ( Dep. Quimica).
Lieu de préparation: Universidad Politécnica de Valencia.

Résumé: Le ciclorreversión (CR) oxydatif ou réductrice de oxetanos par transfert électronique fotoinducida (TEF), n'a pas été étudié en profondeur, malgré le fait que ce processus a suscité un grand intérêt dans la dernière décennie en ce qui concerne l'exploration de nouvelles voies de synthèse et de la Photochimie de la réparation de l'ADN. En ce qui concerne via fotooxidativa, en tenant compte des calculs théoriques et de données expérimentales déjà publiées sur son caractère a pensé qu'il serait intéressant de procéder à une étude pilote visant à fournir de nouvelles connaissances sur le mécanisme de réaction. Dans ce contexte, il a été choisi comme modèle le substrat, trans trans-2-ciclopropil-phenyl-3-4-metiloxetano (1) a clarifié les aspects de la mécanique de oxetanos RC oxydatif. La scission de 1 pour rupture initiale lien C2-C3 conduit à l'utilisation de composés dans le fotocicloadición de BÃ ¼ Patero-chi à la synthèse de 1. En revanche, la formation d'un nouveau fotoproducto raison de la capture de nucleofílica intermolecular intermédiaire résultant de la fragmentation de lier O-C2 accepte d'acétonitrile par un mécanisme étapes. En ce qui concerne via fotorreductiva, a été étudié RC modèle du substrat, trans trans-2-(4-cyanophényle)-3-phényl-4-metiloxetano (4) en utilisant le 1-metoxinaftaleno comme photosensibilisateur. Les données expérimentales sont en accord avec la réaction qui a lieu à partir de l'état singulet de la sensibilisant. La fragmentation de l'anion radical de 4 survient en brisant les liens O-C2 et C3-C4 produits phares (l'acétaldéhyde et 4-cianoestilbeno) différentes de celles utilisées pour la synthèse de 4 à la fotociloadición de Paterno-BÃ ¼ chi. Le processus passe par l'anion radical trans-4-cianoestilbeno, qui a été détectée par FDL (? Max = 500 nm).

Auteur: MANOJAS VASTFSÓN MARIA.
Année: 2006.
Université: BARCELONA.
Lieu de préparation: FACULTAD DE FÍSICA.

Résumé: Le travail réalisé dans cette thèse est fondée sur l'étude du pliage et desplegamiento mécanicien molécules d'ARN. L'objectif principal est de développer des modèles fenomenólicos qui sont utiles pour l'interprétation resutlados d'expériences seule molécule pincettes optiques. Notre modèle stratégique est à la fois la molécule d'ARN comme lso différents éléments impliqués dans les expériences pour en extraire l'information thermodynamique et la cinétique du processus de repliement et desplegamiento RNA.

Auteur: MORENO GONZÁLEZ M. CARMEN.
Année: 2006.
Université: GIRONA.
Lieu de l'exposition: ESCUELA POLITÉCNICA SUPERIOR IV.
Lieu de préparation: UNVIERSITAT DE GIRONA.

Résumé: Ces dernières années, notre groupe de recherche a mené plusieurs enquêtes à la recherche de nouveaux agents de lutte biologique efficace dans le contrôle des maladies post-récolte. L'un a été isolé souche EPS125, qui a montré une grande efficacité de la lutte biologique champignon pathogène Penicillium expansum, causant le pourrissement de la bleue et de lourdes pertes économiques en après récolte des fruits. Cette souche a également révélé efficace contre une large gamme d'agents pathogènes fongiques post-récolte comme Botrytis cinerea, Monilinia laxiste et Rhizopus stolonnifer et dans une grande variété de fruits. En raison de sa grande efficacité, a été soulevée développer commercialement cette souche, toutefois, pour atteindre cet objectif devrait être de mener une étude approfondie de la caractérisation niveau de l'identification des produits, la production de masse, de la conception, les mécanismes de lutte biologique et la traçabilité. Jusqu'à présent, des questions telles que la production de masse et à la formulation de la souche EPS125 ont été développés avec succès. Aussi, les approximations sur le mécanisme de cette souche de biocontrôle ont été menées, où l'exclusion de la colonisation par des germes pathogènes défensive créneau et interaction directe avec les spores fongiques et les tubes germinativos semblent avoir un rôle clé dans la lutte biologique. Dans le présent travail a été soulevée chercher à compléter les informations nécessaires à l'avenir l'enregistrement des biopesticida EPS125, que vous pouvez tomber: 1 - Identification et caractérisation de la souche EPS125 travers phénotypique et génotypique essais. 2 - Développement d'une méthode de traçage la souche EPS125 grâce à des marqueurs moléculaires. 3 - Détermination du mécanisme utilisé par biocontrôle souche EPS125 contre P.expansum travers des approximations phénotypique et génotypique études. Selon les amener des tests biochimiques et morphologiques, API 20E, les profils Biolog et des acides gras, et le séquençage du gène 16S ADNr, la souche EPS125 est incluse dans les espèces Pantowea agglomerans (Enterobacter agglomerans - Ervinia herbicola). Cette souche a montré des caractéristiques qui diffèrent des autres espèces, et même des pois de la même espèce. Plus précisément, contrairement à d'autres souches analysées, la souche EPS125 n'a pas été en mesure d'utiliser comme source de carbone entre 40, mais au contraire était le seul capable de métaboliser mono- metil Succinate. En outre, en ce qui concerne la teneur en acides gras cellulaires manifesté par la souche EPS125, c'était aussi le seul qui a montré des acides gras 14:1 w5c, SIF1 et 15:0 ISO 3OH. En ce qui concerne la caractérisation génotypique, la souche EPS125 montré un polymorphisme de la longueur des fragments de macrorestricción génomique MRFLP étrange composé de 13 morceaux (302270259253197179165160140110,81 et 71 Ko) à partir de la digestion de l'ADN avec XbaI. Deux marqueurs moléculaires ADN spécifiques (125,2 et 125,3) pour la souche EPS125 ont été développés dans le présent document. Chaque marqueur moléculaire révélée semiespecífico de détection par technique PCR lorsqu'ils sont utilisés séparément amplifiant cinq souches P.agglomernas avec toutes les amorces 125,2 et d'une souche de la même espèce avec toutes les amorces 125,3 pour un total de 267 souches analysées (257 souches de l'espèce P . Agglomerans et 10 souches d'autres genres). Mais, contrairement à d'autres bactéries analysées, les souches EPS125 est le seul qui a montré l'amplification des signaux avec les deux séries d'amorces. Ce résultat suggère l'utilisation éventuelle combinaison des deux marqueurs moléculaires pour étudier le tracé souche EPS 125 dans un PCR réaction mutiplex. P.agglomerans EPS125 a les caractéristiques adaptées à un potentiel biopesticida commerce que de l'absence de vie nucleadora patinoire, ainsi que la sécurité dans les usines. En plus des essais de plantes, cette souche, tam 8 puits nous 1ff8 tró essence de toxicité chez les mammifères comme il est souhaitable. L'efficacité de l'agent biologique P.agglomerans EPS125 pour l'inhibition P.expansum a été déterminée par des essais de la dose, d'où ils extraites paramètres de l'efficacité. Plus précisément, en suivant le modèle de la saturation hyperbolique souche EPS125 était hautement efficace contre P.expansum en montrant à travers une pomme dose effective de 2.7x10 (5) à 7x10 (5) ufc / ml, et un ratio de 25-101 cellules EPS125 pour inactiver Une spore. L'étude du mécanisme employé par P.agglomerans dans la lutte biologique contre P.expansum ont été menés par des approximations phénotypiques et génétiques, les études basées sur l'utilisation de la technique de mutagenèse avec les transposons. Selon les résultats de la caractérisation phénotypique, la production de métabolites antifongiques ainsi que la concurrence pour des éléments nutritifs ne semblent être les principaux mécanismes responsables de la capacité inhibitrice de la souche EPS125. En revanche, les interactions directes entre les cellules agent de lutte biologique et les spores de l'agent pathogène est nécessaire pour atteindre une inhibition de la germination de spores EP.exampsum et donc l'infection. Les observations faites acte cultures P.agglomerans EPS125 cultivés dans le jus de pomme montrer tout comme une série impressionnante de filament comme pili de type IV de l'interconnexion des cellules ou pluricellulaires grappes "symplasmata" enveloppé dans une couche de l'alginate. Ces observations donnent à penser que les deux filaments, qui pourrait être responsable de la circulation comme "Tics" conduisant à la formation d'microcolonias, comme glinato, dont la production est influencée par les conditions de croissance pourrait intervenir dans les premiers stades de la formation de tables ou microbiens Biofilms par P.agglomerans EPS125, ainsi que de jouer un rôle clé dans l'inhibition de la germination des spores de l'agent pathogène. Pour vraiment prouver ce mécanisme est responsable de l'activité biocontrolador de P.agglomerans EPS125 a utilisé l'analyse génétique de mutants défectueux en biocontrôle de P.expansum en pomme obtenues par mutagenèse aléatoire avec minitransposón GUS (mTn5SSgusA40). Ainsi, 7 des mutants complètement défectueux en biocontrôle de pourriture bleu (m40, m439, m622, m1212, m2002, m2126 et m4015 () ont été choisis parmi un total de 4032 des mutants pas auxotróficos. Dichois des mutants ont montré une morphologie similaire coloniale au-dessus de la moyenne minimale ABM; Courbes de croissance au milieu des trains LB liquide propageant dans manaza à 13 et 23 ° C, moléculaire quorum, les signaux des capteurs, et de la qualité de la production de l'alginate. Phénotypiques divergences concernant la souche seulement ont été observées dans les mutants m2126 et m4015 dans le cadre de la protéine déduite hypothétique In silico de montre de 35% d'identité de séquence avec maino acides de la protéine dihidrodipicolinato sintas DHDPS différentes bactéries. DHDPS est une enzyme clé dans la voie de biosynthèse méso diaminopimelato (méso DAP) dans des bactéries et des plantes, qui est un élément essentiel delà Mur peptidoglicano bactériennes et repercusores directe la lysine. Raison de mutants m40 n'est pas auxótrofo pour la lysine et possède la route biosintética de DAP reste inchangé en mesure de croître au milieu de moins de trois insérés les transposons dans son génome, et le séquençage nucleítidca flanqueante les transposons montré aucune similitude à tout Séquence actuellement placées dans la base de données GEnBank, cette mutante jetés comme candidate à prendre en considération dans ce travail. Hypothétique protéines déduites de la séquence de nucléotides des mutants m2126 de 876 à 1392 de 48 à 753 b partagé similitude avec un hypothétique de protéines de fonction inconnue De Comamonas ps 33% de protéines et de la famille de luciferasa bactériennes 55% respectivement. Conformément à la bibliographie et les résultats décrits dans le présent document, tout semble indiquer que la mutation produites dans la mutante m2126 pourrait avoir modifié un luciferasa FMN - dependiente (LuxAB ) Liés gène quorum exigé par la réglementation du système de détection affectant éventuellement la production de filaments semblables à celles pili de type IV et la formation ultérieure de biofilms. Déduite des séquences de protéines mutantes m4015 montré 41% d'identité avec la lysine / ornithine N - monoxigenasas impliqués dans le parcours biosintética de Sideróforos de type aerobactina. Soupçonné d'insertion transposón dans les mutants m4015 pourrait nuire à la capacité de cet élément à P.expasum, ce qui est indispensable pour indiquer le processus de la germination des spores. Finalement, la séquence de nucléotides des mutants m2002 et m4015 montré une 90 % D'identité de séquence d'insertion IS1222, qui brut par les suppressions et les translocations contribuer génétiques processus de souplesse et d'adaptation à l'environnement. Dépit nucleotídicas que les deux séquences sont identiques, le point d'insertion de tranposón dans les deux mutantes était différent car les modes obtenus dans le sud et le Caractéristiques fonotípicas des deux ne correspond pas à celui des mutants. Les résultats obtenus dans le présent document, il est possible de créer un scénario de la formation des biofilms en P.agglomerans EPS125, qui est impliqué dans l'inhibition de la germination des spores de l'agent pathogène. Abord, les cellules Antagonistes de s'en tenir à la surface de la blessure du bloc en utilisant une variété de composants tels que les cellulaires filament comme pilil de type IV algianto. Ce type de cheveux de filaments pourrait lier à différentes surfaces y compris d'autres cellules sbacterianas et spores pathogène prudiciendo mobilité taux "tics" par polymérisation Et le retrait de la filaments de pilosos. Ce mouvement sur les cellules de faciliter la formation d'agglomérats mutlicelulares, et enfin microcolonias où comprendrait les spores de l'agent pathogène. Parallèles, la première adhésion des cellules les antagonistes est suivie par la production de polsiacáridos extracellulaire type de l L'alginate, qui est induit sous certaines conditions. Outre, les cellules EPS125 pourrait être en mesure de capturer fer moitié grâce siderófors diminuant leur disponibilité pour les cellules pathogènes et à empêcher le processus de germination. Ensuite le microenvironnement formé par la souche EPS125 pourrait réduire la Disponibilité des différents composés comme l'eau, l'oxygène ou de fer qui sont essentiels à la germination des connue P.expansum. Outre, la souche EPS125 produit des molécules impliquées dans la détection HSL quorum exigé par la réglementation des gènes qui pourraient être responsables de la différenciation des biofilms et de son Activité biocontroladora. Plus précisément, elle pourrait être directement liée à la formation des filaments pilosos importante dans le processus de différenciation des tapis microbiens, et d'autres mécanismes de lutte biologique inconnu employés par l'agent de contrôle biologique. Brièvement, il biofilms formés par P.agglomerans EPS125 constitue une bonne Environnement propice à leur croissance, leur structure physique permet de résister à l'agression environnementale et inhibe l'infection provoquée par P.expansum privant les spores des composantes essentielles comme l'eau. Oxygène ou de fer, qui pousse le processus de germination. En conclusion, les résultats présentés dans le présent document développe les connaissances sur Le comportement de P.agglomerans dans son environnement naturel, et à renforcer la pertinence de ce stade comme un intéressant biopersticida pour être commercialement développés.